На 70-80% вероятности этот стук означает, что забит теплообменник котла. Возрастающий слой оксида на внутренних стенках теплообменника не позволяет нормально снимать тепло с него, и устройство скоро выйдет из строя. Мастер по ремонту газовых котлов должен определить, так ли это, или просто некорректно смонтирована гидравлика. Такой вариант тоже может быть. Промывка теплообменника изнутри химическими средствами стоит порядка 40 тыс. рублей.